Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm27Q5SFM8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm27Q5SFM8 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm27Q5SFM8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm27Q5SFM8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm27Q5SFM8 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm27Q5SFM8 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm27Q5SFM8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm27Q5SFM8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm27Q5SFM8 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm27Q5SFM8 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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