Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm3550-201ENSMUST00000105038 1656 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Olfr631-201ENSMUST00000106863 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm12170-201ENSMUST00000119281 300 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Cyb5a-205ENSMUST00000163083 676 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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