Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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