Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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PtpreP49446 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms