Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rfx1P48377 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rfx1P48377 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx1P48377 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms