Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
DmdP11531 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
DmdP11531 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
DmdP11531 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 2900011O08Rik-201ENSMUST00000056521 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Elof1-201ENSMUST00000013966 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm32849-201ENSMUST00000208696 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm12338-201ENSMUST00000122170 192 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm7924-201ENSMUST00000203975 785 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm42402-201ENSMUST00000208341 1054 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DmdP11531 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Chrne-202ENSMUST00000102556 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm13629-201ENSMUST00000141149 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm7997-201ENSMUST00000210546 980 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm6129-201ENSMUST00000220725 801 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Lgals8-206ENSMUST00000135166 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Tph1-202ENSMUST00000107669 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 E130114P18Rik-209ENSMUST00000186369 306 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Il24-202ENSMUST00000187650 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Katna1-202ENSMUST00000165806 1775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Katna1-201ENSMUST00000019929 1774 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Stard4-202ENSMUST00000118990 648 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm8091-201ENSMUST00000150506 886 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DmdP11531 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 1700018A04Rik-203ENSMUST00000150418 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 Prdx5-204ENSMUST00000173091 501 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 Rpl15-ps3-201ENSMUST00000088480 615 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 Prdx1-204ENSMUST00000135573 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm24180-201ENSMUST00000179961 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms