Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01641 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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P01641 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01641 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01641 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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