Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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