Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms