Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Hdac5Q9Z2V6 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Hdac5Q9Z2V6 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Hdac5Q9Z2V6 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Hdac5Q9Z2V6 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Hdac5Q9Z2V6 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Hdac5Q9Z2V6 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Hdac5Q9Z2V6 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Hdac5Q9Z2V6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Hdac5Q9Z2V6 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Hdac5Q9Z2V6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Hdac5Q9Z2V6 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Hdac5Q9Z2V6 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Hdac5Q9Z2V6 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Hdac5Q9Z2V6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Hdac5Q9Z2V6 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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