Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6B2

Rtkn, Rhotekin, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtknQ8C6B2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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RtknQ8C6B2 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RtknQ8C6B2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RtknQ8C6B2 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RtknQ8C6B2 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RtknQ8C6B2 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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RtknQ8C6B2 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RtknQ8C6B2 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RtknQ8C6B2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms