Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atg16l1Q8C0J2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atg16l1Q8C0J2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atg16l1Q8C0J2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atg16l1Q8C0J2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atg16l1Q8C0J2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atg16l1Q8C0J2 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atg16l1Q8C0J2 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Atg16l1Q8C0J2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Atg16l1Q8C0J2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Atg16l1Q8C0J2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Atg16l1Q8C0J2 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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