Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms