Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms