Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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Ccl20O89093 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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