Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vmn1r34G3XA52 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vmn1r34G3XA52 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vmn1r34G3XA52 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vmn1r34G3XA52 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vmn1r34G3XA52 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vmn1r34G3XA52 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vmn1r34G3XA52 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vmn1r34G3XA52 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms