Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Atp8b5A3FIN4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Atp8b5A3FIN4 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms