Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tlr5Q9JLF7 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms