Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms