Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms