Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms