Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms