Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 AC160138.2-201ENSMUST00000220255 1531 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm8817-201ENSMUST00000126769 693 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Rpl21-ps2-201ENSMUST00000222933 481 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Rpl15-ps3-201ENSMUST00000088480 615 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 2310016D03Rik-201ENSMUST00000190206 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Stard4-202ENSMUST00000118990 648 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm25426-201ENSMUST00000157606 170 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Ccdc28a-205ENSMUST00000174592 882 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 4933439N14Rik-201ENSMUST00000211062 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Calb2-202ENSMUST00000212297 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 AC153948.2-201ENSMUST00000218112 505 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Tssk4-204ENSMUST00000226591 1243 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176 ms