Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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