Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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