Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
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Lrrc43Q3V0L5 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 AC153974.1-202ENSMUST00000218700 678 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm3550-201ENSMUST00000105038 1656 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Nme7-201ENSMUST00000086028 834 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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