Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms