Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Zmynd8-204ENSMUST00000109262 2515 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Fam32a-201ENSMUST00000003123 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Acad10-201ENSMUST00000031412 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpc-201ENSMUST00000111610 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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