Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim24Q0VG18 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms