Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms