Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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NfiaQ02780 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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NfiaQ02780 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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NfiaQ02780 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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NfiaQ02780 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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NfiaQ02780 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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NfiaQ02780 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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NfiaQ02780 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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