Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Prdm6-202ENSMUST00000115398 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Grin2cQ01098 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms