Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoa1Q00623 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms