Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Serping1-202ENSMUST00000111641 1665 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm42811-201ENSMUST00000201951 2768 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Acsl6-205ENSMUST00000094194 2554 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cdk20-201ENSMUST00000021939 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gramd1b-203ENSMUST00000119373 3857 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm38340-201ENSMUST00000195039 4008 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Adamts4-201ENSMUST00000111314 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm9979-201ENSMUST00000069457 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Zcchc12-203ENSMUST00000115257 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 B3galt5-202ENSMUST00000113800 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Mia3-202ENSMUST00000109158 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm42777-201ENSMUST00000196026 3603 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Cald1-204ENSMUST00000115026 4080 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm18981-201ENSMUST00000185373 1599 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Washc4-201ENSMUST00000038388 5858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Osbpl3-201ENSMUST00000071728 3307 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm43457-201ENSMUST00000200867 2409 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Zbtb8os-204ENSMUST00000141235 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gpatch2l-201ENSMUST00000071106 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms