Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms