Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms