Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms