Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VimP20152 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VimP20152 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
VimP20152 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
VimP20152 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
VimP20152 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms