Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Sfta2-201ENSMUST00000171166 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Cryab-206ENSMUST00000217475 1117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Il24-201ENSMUST00000121040 1159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Ccdc28a-205ENSMUST00000174592 882 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Etfbkmt-202ENSMUST00000111547 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm13861-201ENSMUST00000137136 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 A730090N16Rik-201ENSMUST00000160137 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Ucma-202ENSMUST00000115010 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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DmdP11531 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm38839-201ENSMUST00000203833 633 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 6430531B16Rik-205ENSMUST00000210254 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
DmdP11531 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
DmdP11531 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
DmdP11531 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
DmdP11531 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
DmdP11531 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm12133-201ENSMUST00000121775 661 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
DmdP11531 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm21917-203ENSMUST00000180309 561 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm7516-201ENSMUST00000186198 706 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm42620-201ENSMUST00000197715 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
DmdP11531 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
DmdP11531 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
DmdP11531 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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