Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P10404 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P10404 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
P10404 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
P10404 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
P10404 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
P10404 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
P10404 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
P10404 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
P10404 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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