Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms