Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms