Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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ChmQ9QXG2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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