Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sp6Q9ESX2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sp6Q9ESX2 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 337.4 ms