Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms