Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms