Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 Olfr1349-201ENSMUST00000051982 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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