Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms