Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rufy1Q8BIJ7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms