Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms